农村进行房屋登记的原因是多方面的，主要包括以下几点：
推动城乡一体化建设
通过房屋登记，政府可以更好地了解农村住房的现状，为城乡一体化建设政策的推动提供辅助。这有助于防止违规建筑，确保新农村地区的规划得以顺利实施。
保护农民合法权益
房屋登记能够明确宅基地的面积、位置和使用权限，有效保护农民的合法权益，避免权属争议。农民可以凭借权属证书维护自己的利益，防止因权属不清导致的矛盾纠纷。
规范农村土地市场
通过登记制度，可以规范农村土地市场，防止非法转让和侵占行为，促进农村经济的健康发展。明确的权属有助于政府高效监管宅基地分配，确保资源合理使用。
便于管理和监督
建立农村宅基地数据库，便于随时查询每个家庭的宅基地详细信息，提高管理效率。这有助于政府审核新宅基地申请，严格把控申请条件，避免资源滥用。
促进财产权利流转
房屋确权登记后，农民可以更便捷地进行财产权利流转，如出租、出资、抵押或转让，从而增加财产性收入。这有助于农民更好地利用自己的资产，满足资金融通的需求。
维护交易安全
确权登记能够提升交易安全性，农民可以随时查询房屋状况，避免一地数租或一房多售的风险。这有助于保护农民的合法权益，维护市场秩序。
减轻农民负担
确权登记有助于减轻农民在行政事务中的负担，精简办证流程，降低相关费用支出。这有助于提高农民的生活水平，促进农村社会的和谐稳定。
综上所述，农村房屋登记不仅有助于保护农民的合法权益，规范农村土地市场，还能推动城乡一体化建设，促进农村经济的健康发展，并为农民提供更为便捷的财产权利流转服务。