翻建批示丢失后，您可以按照以下步骤进行调取和补办：
查询原始档案
到当地乡镇政府或相关土地管理部门查询原始档案，看是否有留存的记录。若能查到，可依据此进行确权。
收集其他证据
若无法查到宅基地批示的原始档案，您需要收集其他能证明宅基地权属的相关证据，如宅基地上房屋的产权证明、长期居住使用的证明、村集体出具的证明等。
提出确权申请
向所在村集体提出确权申请，并按照当地的确权流程和要求，填写相关表格、提交证明材料。
解决争议
在确权过程中，可能需要经过实地调查、公示等程序。若遇争议，可能需要通过调解、行政裁决或诉讼等途径解决。
建议您尽快联系当地乡镇政府或土地管理部门，获取相关档案和证明文件，以便顺利进行后续的确权和翻建手续。