当遇到商品缺斤短两的情况时，消费者可以选择以下部门进行投诉或举报：
工商行政管理部门：
根据《中华人民共和国消费者权益保护法》第三十九条，消费者可以向工商行政管理部门举报。
市场监督管理部门：
市场监督管理部门负责监管市场行为，包括商品的计量准确性。消费者可以向市场监督管理部门举报。
消费者协会：
消费者协会是保护消费者权益的组织，消费者可以向消费者协会投诉。
12315热线电话：
拨打12315热线电话进行举报或投诉，这是一个便捷的途径。
质量技术监督部门：
根据《中华人民共和国计量法》第四条，质量技术监督部门负责监督定量包装商品的计量准确性，并对违法行为进行查处。
综上所述，消费者在遇到商品缺斤短两的情况时，可以向多个部门进行投诉或举报，具体选择哪个部门可以根据个人习惯和实际情况来决定。如果需要更快速地解决问题，建议拨打12315热线电话进行投诉，因为该热线通常能够快速将投诉转交给相关部门进行处理。